Magister wordt vanaf klas 3 gebruikt voor het huiswerk, alle dagelijkse roosterwijzigingen), voor registratie van afwezigheid, te laat komen, cijfers en werkhouding. Ook kunnen ouders/verzorgers zich via Magister inschrijven voor een ouderavond.
Daarnaast maken docenten gebruik van het Magisteronderdeel ELO (elektronische leeromgeving). Hier zijn studiewijzers, digitaal materiaal en digitale opdrachten te vinden. Ook het inschrijven voor activiteiten op school, zoals inhaaltoetsen en Hagevelduren, gaat via Magister. Ten slotte registreert de mentor ten behoeve van de begeleiding relevante informatie over leerlingen in Magister.
